Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frat1P70339 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frat1P70339 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frat1P70339 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frat1P70339 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frat1P70339 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frat1P70339 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frat1P70339 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frat1P70339 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frat1P70339 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frat1P70339 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 716.6 ms