Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb4bP68372 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tubb4bP68372 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubb4bP68372 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms