Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Eif3eP60229 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Eif3eP60229 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Eif3eP60229 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms