Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pcif1P59114 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcif1P59114 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcif1P59114 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms