Protein–RNA interactions for Protein: P54116

Stom, Erythrocyte band 7 integral membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StomP54116 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
StomP54116 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
StomP54116 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
StomP54116 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
StomP54116 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
StomP54116 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
StomP54116 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
StomP54116 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
StomP54116 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
StomP54116 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
StomP54116 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
StomP54116 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
StomP54116 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
StomP54116 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
StomP54116 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
StomP54116 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
StomP54116 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
StomP54116 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
StomP54116 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
StomP54116 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
StomP54116 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
StomP54116 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
StomP54116 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StomP54116 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StomP54116 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StomP54116 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StomP54116 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StomP54116 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StomP54116 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
StomP54116 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
StomP54116 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
StomP54116 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StomP54116 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
StomP54116 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
StomP54116 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
StomP54116 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
StomP54116 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
StomP54116 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
StomP54116 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
StomP54116 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
StomP54116 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
StomP54116 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
StomP54116 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
StomP54116 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
StomP54116 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
StomP54116 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
StomP54116 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
StomP54116 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
StomP54116 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
StomP54116 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
StomP54116 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
StomP54116 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
StomP54116 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
StomP54116 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
StomP54116 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
StomP54116 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
StomP54116 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
StomP54116 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
StomP54116 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
StomP54116 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
StomP54116 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
StomP54116 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
StomP54116 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
StomP54116 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
StomP54116 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
StomP54116 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
StomP54116 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
StomP54116 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
StomP54116 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
StomP54116 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
StomP54116 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
StomP54116 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
StomP54116 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
StomP54116 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
StomP54116 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
StomP54116 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
StomP54116 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
StomP54116 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
StomP54116 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
StomP54116 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
StomP54116 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
StomP54116 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
StomP54116 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
StomP54116 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
StomP54116 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
StomP54116 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
StomP54116 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
StomP54116 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
StomP54116 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
StomP54116 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
StomP54116 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
StomP54116 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
StomP54116 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
StomP54116 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
StomP54116 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
StomP54116 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
StomP54116 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
StomP54116 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
StomP54116 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
StomP54116 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms