Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpc4P51655 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gpc4P51655 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gpc4P51655 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms