Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psen1P49769 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psen1P49769 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Psen1P49769 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Psen1P49769 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psen1P49769 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psen1P49769 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Psen1P49769 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psen1P49769 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Psen1P49769 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Psen1P49769 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms