Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox2P48432 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox2P48432 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox2P48432 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Sox2P48432 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox2P48432 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox2P48432 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox2P48432 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox2P48432 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox2P48432 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox2P48432 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Sox2P48432 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sox2P48432 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sox2P48432 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sox2P48432 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sox2P48432 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Sox2P48432 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox2P48432 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox2P48432 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sox2P48432 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox2P48432 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sox2P48432 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sox2P48432 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox2P48432 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox2P48432 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox2P48432 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox2P48432 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox2P48432 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox2P48432 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox2P48432 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox2P48432 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox2P48432 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox2P48432 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox2P48432 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox2P48432 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox2P48432 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox2P48432 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox2P48432 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sox2P48432 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox2P48432 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sox2P48432 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms