Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msh2P43247 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msh2P43247 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msh2P43247 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msh2P43247 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msh2P43247 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msh2P43247 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msh2P43247 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msh2P43247 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msh2P43247 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msh2P43247 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msh2P43247 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msh2P43247 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msh2P43247 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msh2P43247 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msh2P43247 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msh2P43247 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msh2P43247 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msh2P43247 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msh2P43247 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msh2P43247 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msh2P43247 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msh2P43247 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msh2P43247 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msh2P43247 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms