Protein–RNA interactions for Protein: P37172

Acvr1, Activin receptor type-1, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acvr1P37172 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Acvr1P37172 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Acvr1P37172 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Acvr1P37172 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Acvr1P37172 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Acvr1P37172 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Acvr1P37172 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Acvr1P37172 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Acvr1P37172 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Acvr1P37172 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Acvr1P37172 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Acvr1P37172 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Acvr1P37172 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Acvr1P37172 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Acvr1P37172 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Acvr1P37172 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Acvr1P37172 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Acvr1P37172 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Acvr1P37172 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Acvr1P37172 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Acvr1P37172 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Acvr1P37172 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Acvr1P37172 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms