Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rab6aP35279 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab6aP35279 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms