Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SsbP32067 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SsbP32067 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SsbP32067 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SsbP32067 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SsbP32067 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SsbP32067 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SsbP32067 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SsbP32067 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SsbP32067 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SsbP32067 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SsbP32067 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SsbP32067 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SsbP32067 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SsbP32067 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SsbP32067 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SsbP32067 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SsbP32067 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SsbP32067 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SsbP32067 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SsbP32067 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SsbP32067 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SsbP32067 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SsbP32067 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SsbP32067 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SsbP32067 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SsbP32067 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SsbP32067 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SsbP32067 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SsbP32067 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SsbP32067 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SsbP32067 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SsbP32067 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SsbP32067 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SsbP32067 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SsbP32067 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SsbP32067 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SsbP32067 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SsbP32067 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SsbP32067 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SsbP32067 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SsbP32067 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SsbP32067 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SsbP32067 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SsbP32067 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SsbP32067 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SsbP32067 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SsbP32067 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SsbP32067 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SsbP32067 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SsbP32067 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SsbP32067 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SsbP32067 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SsbP32067 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SsbP32067 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SsbP32067 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SsbP32067 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SsbP32067 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SsbP32067 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SsbP32067 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SsbP32067 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SsbP32067 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SsbP32067 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SsbP32067 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SsbP32067 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SsbP32067 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SsbP32067 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SsbP32067 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SsbP32067 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SsbP32067 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SsbP32067 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SsbP32067 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SsbP32067 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SsbP32067 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SsbP32067 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SsbP32067 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SsbP32067 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SsbP32067 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SsbP32067 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SsbP32067 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SsbP32067 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SsbP32067 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SsbP32067 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SsbP32067 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SsbP32067 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SsbP32067 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SsbP32067 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SsbP32067 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SsbP32067 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SsbP32067 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SsbP32067 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SsbP32067 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SsbP32067 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SsbP32067 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SsbP32067 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SsbP32067 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SsbP32067 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SsbP32067 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SsbP32067 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SsbP32067 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151 ms