Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tacr1P30548 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tacr1P30548 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tacr1P30548 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tacr1P30548 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tacr1P30548 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tacr1P30548 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tacr1P30548 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tacr1P30548 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tacr1P30548 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tacr1P30548 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tacr1P30548 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Tacr1P30548 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tacr1P30548 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tacr1P30548 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tacr1P30548 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tacr1P30548 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tacr1P30548 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tacr1P30548 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tacr1P30548 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tacr1P30548 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tacr1P30548 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tacr1P30548 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tacr1P30548 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms