Protein–RNA interactions for Protein: P27671

Rasgrf1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgrf1P27671 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasgrf1P27671 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasgrf1P27671 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasgrf1P27671 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasgrf1P27671 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rasgrf1P27671 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasgrf1P27671 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasgrf1P27671 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasgrf1P27671 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasgrf1P27671 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rasgrf1P27671 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rasgrf1P27671 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rasgrf1P27671 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rasgrf1P27671 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rasgrf1P27671 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rasgrf1P27671 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rasgrf1P27671 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms