Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Fcer1aP20489 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Fcer1aP20489 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Fcer1aP20489 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms