Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NelfeP19426 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NelfeP19426 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NelfeP19426 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NelfeP19426 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NelfeP19426 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NelfeP19426 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NelfeP19426 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NelfeP19426 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NelfeP19426 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NelfeP19426 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NelfeP19426 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NelfeP19426 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NelfeP19426 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NelfeP19426 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NelfeP19426 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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