Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NefhP19246 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NefhP19246 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NefhP19246 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NefhP19246 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NefhP19246 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NefhP19246 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NefhP19246 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NefhP19246 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NefhP19246 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NefhP19246 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NefhP19246 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NefhP19246 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NefhP19246 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefhP19246 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefhP19246 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefhP19246 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefhP19246 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefhP19246 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefhP19246 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NefhP19246 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NefhP19246 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NefhP19246 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NefhP19246 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NefhP19246 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NefhP19246 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NefhP19246 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NefhP19246 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NefhP19246 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NefhP19246 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NefhP19246 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NefhP19246 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NefhP19246 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NefhP19246 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NefhP19246 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NefhP19246 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NefhP19246 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NefhP19246 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NefhP19246 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NefhP19246 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NefhP19246 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NefhP19246 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NefhP19246 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NefhP19246 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NefhP19246 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NefhP19246 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NefhP19246 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NefhP19246 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NefhP19246 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NefhP19246 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NefhP19246 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NefhP19246 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NefhP19246 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NefhP19246 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NefhP19246 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NefhP19246 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NefhP19246 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NefhP19246 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NefhP19246 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NefhP19246 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NefhP19246 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NefhP19246 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NefhP19246 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NefhP19246 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NefhP19246 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NefhP19246 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NefhP19246 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NefhP19246 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NefhP19246 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NefhP19246 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NefhP19246 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NefhP19246 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NefhP19246 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NefhP19246 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NefhP19246 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NefhP19246 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NefhP19246 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NefhP19246 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NefhP19246 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NefhP19246 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NefhP19246 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NefhP19246 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NefhP19246 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NefhP19246 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NefhP19246 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NefhP19246 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NefhP19246 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NefhP19246 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NefhP19246 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NefhP19246 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NefhP19246 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NefhP19246 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NefhP19246 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NefhP19246 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NefhP19246 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NefhP19246 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NefhP19246 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NefhP19246 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NefhP19246 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NefhP19246 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms