Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RargP18911 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RargP18911 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RargP18911 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RargP18911 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RargP18911 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RargP18911 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RargP18911 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RargP18911 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RargP18911 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RargP18911 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RargP18911 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RargP18911 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RargP18911 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RargP18911 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RargP18911 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RargP18911 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RargP18911 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RargP18911 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RargP18911 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RargP18911 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RargP18911 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RargP18911 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RargP18911 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RargP18911 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RargP18911 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RargP18911 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RargP18911 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RargP18911 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RargP18911 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RargP18911 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RargP18911 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RargP18911 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RargP18911 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RargP18911 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RargP18911 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RargP18911 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RargP18911 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RargP18911 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RargP18911 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RargP18911 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RargP18911 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RargP18911 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RargP18911 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RargP18911 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RargP18911 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RargP18911 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RargP18911 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RargP18911 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RargP18911 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RargP18911 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RargP18911 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RargP18911 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RargP18911 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RargP18911 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RargP18911 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RargP18911 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RargP18911 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RargP18911 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RargP18911 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RargP18911 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RargP18911 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RargP18911 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RargP18911 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RargP18911 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RargP18911 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RargP18911 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RargP18911 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RargP18911 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RargP18911 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RargP18911 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RargP18911 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RargP18911 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RargP18911 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RargP18911 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RargP18911 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RargP18911 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RargP18911 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RargP18911 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RargP18911 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RargP18911 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RargP18911 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RargP18911 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RargP18911 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RargP18911 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RargP18911 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RargP18911 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RargP18911 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RargP18911 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RargP18911 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RargP18911 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RargP18911 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RargP18911 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RargP18911 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RargP18911 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RargP18911 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RargP18911 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RargP18911 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RargP18911 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RargP18911 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms