Protein–RNA interactions for Protein: P11983

Tcp1, T-complex protein 1 subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcp1P11983 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tcp1P11983 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcp1P11983 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tcp1P11983 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 222.1 ms