Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prf1P10820 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prf1P10820 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prf1P10820 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prf1P10820 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prf1P10820 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prf1P10820 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Prf1P10820 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prf1P10820 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Prf1P10820 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Prf1P10820 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prf1P10820 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prf1P10820 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prf1P10820 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prf1P10820 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prf1P10820 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms