Protein–RNA interactions for Protein: P08730

Krt13, Keratin, type I cytoskeletal 13, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt13P08730 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt13P08730 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt13P08730 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt13P08730 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt13P08730 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt13P08730 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Krt13P08730 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt13P08730 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt13P08730 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt13P08730 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt13P08730 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt13P08730 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt13P08730 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt13P08730 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt13P08730 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms