Protein–RNA interactions for Protein: P01793

Ig heavy chain V region HPCG13, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01793 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01793 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01793 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01793 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01793 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01793 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01793 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01793 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01793 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01793 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01793 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01793 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01793 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01793 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01793 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01793 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01793 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01793 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01793 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01793 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01793 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01793 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01793 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01793 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01793 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01793 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01793 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01793 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01793 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01793 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01793 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01793 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01793 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01793 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01793 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01793 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01793 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01793 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01793 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01793 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01793 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01793 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01793 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01793 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01793 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01793 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01793 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01793 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01793 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01793 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01793 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01793 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01793 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01793 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01793 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01793 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01793 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01793 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01793 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01793 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01793 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01793 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01793 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01793 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01793 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01793 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01793 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01793 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01793 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01793 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01793 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01793 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01793 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01793 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01793 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01793 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01793 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01793 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01793 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01793 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01793 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01793 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01793 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01793 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01793 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01793 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01793 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01793 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01793 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01793 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01793 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01793 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01793 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01793 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01793 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01793 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01793 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01793 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01793 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01793 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms