Protein–RNA interactions for Protein: P01739

T-cell receptor alpha chain V region 2B4, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01739 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01739 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01739 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01739 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01739 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01739 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01739 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01739 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01739 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01739 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01739 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01739 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01739 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01739 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01739 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01739 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01739 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01739 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01739 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01739 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01739 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01739 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01739 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01739 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01739 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01739 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01739 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01739 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01739 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01739 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01739 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01739 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01739 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01739 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01739 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01739 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01739 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01739 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01739 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01739 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01739 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01739 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01739 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01739 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01739 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01739 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01739 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01739 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01739 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01739 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01739 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01739 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01739 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01739 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01739 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01739 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01739 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01739 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01739 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01739 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01739 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01739 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01739 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01739 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01739 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01739 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01739 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01739 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01739 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01739 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01739 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01739 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01739 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01739 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01739 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01739 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01739 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01739 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01739 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01739 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01739 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01739 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01739 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01739 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01739 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01739 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01739 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01739 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01739 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01739 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01739 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01739 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01739 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01739 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01739 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01739 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01739 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01739 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01739 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01739 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms