Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
JtbO88824 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
JtbO88824 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
JtbO88824 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
JtbO88824 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
JtbO88824 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JtbO88824 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
JtbO88824 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
JtbO88824 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JtbO88824 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
JtbO88824 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JtbO88824 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JtbO88824 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
JtbO88824 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
JtbO88824 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
JtbO88824 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
JtbO88824 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
JtbO88824 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JtbO88824 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
JtbO88824 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
JtbO88824 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JtbO88824 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
JtbO88824 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
JtbO88824 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
JtbO88824 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JtbO88824 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JtbO88824 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
JtbO88824 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
JtbO88824 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
JtbO88824 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
JtbO88824 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
JtbO88824 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
JtbO88824 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
JtbO88824 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
JtbO88824 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
JtbO88824 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
JtbO88824 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
JtbO88824 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
JtbO88824 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
JtbO88824 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
JtbO88824 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
JtbO88824 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JtbO88824 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JtbO88824 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
JtbO88824 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
JtbO88824 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
JtbO88824 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JtbO88824 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
JtbO88824 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JtbO88824 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JtbO88824 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JtbO88824 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
JtbO88824 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JtbO88824 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
JtbO88824 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JtbO88824 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
JtbO88824 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JtbO88824 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
JtbO88824 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
JtbO88824 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
JtbO88824 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
JtbO88824 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
JtbO88824 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
JtbO88824 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
JtbO88824 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
JtbO88824 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
JtbO88824 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JtbO88824 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JtbO88824 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JtbO88824 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JtbO88824 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JtbO88824 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JtbO88824 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
JtbO88824 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
JtbO88824 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
JtbO88824 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JtbO88824 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
JtbO88824 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JtbO88824 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JtbO88824 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JtbO88824 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JtbO88824 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
JtbO88824 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JtbO88824 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
JtbO88824 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
JtbO88824 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
JtbO88824 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
JtbO88824 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
JtbO88824 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JtbO88824 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
JtbO88824 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
JtbO88824 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JtbO88824 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JtbO88824 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
JtbO88824 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JtbO88824 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
JtbO88824 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JtbO88824 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
JtbO88824 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
JtbO88824 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms