Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp2O88623 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp2O88623 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp2O88623 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp2O88623 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Usp2O88623 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp2O88623 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp2O88623 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp2O88623 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp2O88623 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp2O88623 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp2O88623 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp2O88623 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp2O88623 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp2O88623 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp2O88623 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Usp2O88623 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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