Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnnt1O88346 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnnt1O88346 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnnt1O88346 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms