Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RngttO55236 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RngttO55236 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RngttO55236 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RngttO55236 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RngttO55236 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RngttO55236 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RngttO55236 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RngttO55236 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RngttO55236 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RngttO55236 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RngttO55236 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RngttO55236 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RngttO55236 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RngttO55236 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RngttO55236 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RngttO55236 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RngttO55236 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RngttO55236 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RngttO55236 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RngttO55236 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RngttO55236 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RngttO55236 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RngttO55236 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RngttO55236 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RngttO55236 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RngttO55236 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RngttO55236 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RngttO55236 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RngttO55236 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RngttO55236 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RngttO55236 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RngttO55236 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RngttO55236 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RngttO55236 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RngttO55236 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RngttO55236 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RngttO55236 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RngttO55236 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
RngttO55236 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
RngttO55236 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RngttO55236 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RngttO55236 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RngttO55236 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
RngttO55236 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RngttO55236 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RngttO55236 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RngttO55236 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RngttO55236 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RngttO55236 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RngttO55236 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RngttO55236 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RngttO55236 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
RngttO55236 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RngttO55236 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RngttO55236 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RngttO55236 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RngttO55236 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RngttO55236 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RngttO55236 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
RngttO55236 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RngttO55236 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
RngttO55236 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RngttO55236 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RngttO55236 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RngttO55236 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RngttO55236 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RngttO55236 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RngttO55236 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RngttO55236 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RngttO55236 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RngttO55236 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RngttO55236 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RngttO55236 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RngttO55236 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RngttO55236 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RngttO55236 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RngttO55236 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RngttO55236 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RngttO55236 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RngttO55236 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RngttO55236 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RngttO55236 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RngttO55236 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RngttO55236 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RngttO55236 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RngttO55236 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RngttO55236 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RngttO55236 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RngttO55236 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RngttO55236 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RngttO55236 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RngttO55236 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RngttO55236 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RngttO55236 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RngttO55236 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RngttO55236 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RngttO55236 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RngttO55236 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RngttO55236 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms