Protein–RNA interactions for Protein: O54908

Dkk1, Dickkopf-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk1O54908 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dkk1O54908 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dkk1O54908 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dkk1O54908 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dkk1O54908 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dkk1O54908 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dkk1O54908 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dkk1O54908 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dkk1O54908 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dkk1O54908 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dkk1O54908 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms