Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gp1baO35930 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gp1baO35930 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gp1baO35930 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms