Protein–RNA interactions for Protein: O35929

Rem1, GTP-binding protein REM 1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rem1O35929 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rem1O35929 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rem1O35929 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rem1O35929 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Rem1O35929 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rem1O35929 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rem1O35929 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rem1O35929 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rem1O35929 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Rem1O35929 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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Rem1O35929 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rem1O35929 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rem1O35929 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rem1O35929 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rem1O35929 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rem1O35929 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rem1O35929 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rem1O35929 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rem1O35929 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rem1O35929 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms