Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cdk5r2O35926 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cdk5r2O35926 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cdk5r2O35926 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms