Protein–RNA interactions for Protein: J3QMI4

Calhm3, Calcium homeostasis modulator 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm3J3QMI4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Calhm3J3QMI4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Calhm3J3QMI4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Calhm3J3QMI4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calhm3J3QMI4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.7 ms