Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Arfip1G5E8V9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Arfip1G5E8V9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arfip1G5E8V9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms