Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Colca2F8VPY8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Colca2F8VPY8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Colca2F8VPY8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Colca2F8VPY8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms