Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Usp9yF8VPU6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp9yF8VPU6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp9yF8VPU6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp9yF8VPU6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp9yF8VPU6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp9yF8VPU6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp9yF8VPU6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp9yF8VPU6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp9yF8VPU6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp9yF8VPU6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp9yF8VPU6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp9yF8VPU6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp9yF8VPU6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp9yF8VPU6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp9yF8VPU6 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp9yF8VPU6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp9yF8VPU6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp9yF8VPU6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp9yF8VPU6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms