Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdh9F8VPK8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdh9F8VPK8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdh9F8VPK8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pcdh9F8VPK8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdh9F8VPK8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdh9F8VPK8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pcdh9F8VPK8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcdh9F8VPK8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcdh9F8VPK8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pcdh9F8VPK8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pcdh9F8VPK8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pcdh9F8VPK8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms