Protein–RNA interactions for Protein: F7CCV5

Gm3443, Predicted gene 3443, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3443F7CCV5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3443F7CCV5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3443F7CCV5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms