Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gm5218F6YH22 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm5218F6YH22 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms