Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3M9

2010300C02Rik, RIKEN cDNA 2010300C02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2010300C02RikE9Q3M9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
2010300C02RikE9Q3M9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
2010300C02RikE9Q3M9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
2010300C02RikE9Q3M9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms