Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1Z0

Krt90, Keratin 90, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt90E9Q1Z0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt90E9Q1Z0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt90E9Q1Z0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt90E9Q1Z0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt90E9Q1Z0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt90E9Q1Z0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt90E9Q1Z0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Krt90E9Q1Z0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt90E9Q1Z0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt90E9Q1Z0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt90E9Q1Z0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt90E9Q1Z0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt90E9Q1Z0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Krt90E9Q1Z0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt90E9Q1Z0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt90E9Q1Z0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Krt90E9Q1Z0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Krt90E9Q1Z0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Krt90E9Q1Z0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 906 ms