Protein–RNA interactions for Protein: E9PVR6

Vmn1r1, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r1E9PVR6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn1r1E9PVR6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r1E9PVR6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms