Protein–RNA interactions for Protein: D3YXJ9

Cldn24, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn24D3YXJ9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cldn24D3YXJ9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn24D3YXJ9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms