Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tmf1B9EKI3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tmf1B9EKI3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Tmf1B9EKI3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Tmf1B9EKI3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms