Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E8

Ttll6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll6A4Q9E8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ttll6A4Q9E8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ttll6A4Q9E8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ttll6A4Q9E8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms