Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF7

Plcb2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plcb2A3KGF7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Plcb2A3KGF7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Plcb2A3KGF7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Plcb2A3KGF7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.1 ms