Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc183A2AJB1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc183A2AJB1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc183A2AJB1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms