Protein–RNA interactions for Protein: A2A6T1

Cdr2l, Cerebellar degeneration-related protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr2lA2A6T1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cdr2lA2A6T1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cdr2lA2A6T1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdr2lA2A6T1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms