Protein–RNA interactions for Protein: A2A5N3

Pabpc1l, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1lA2A5N3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pabpc1lA2A5N3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pabpc1lA2A5N3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pabpc1lA2A5N3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pabpc1lA2A5N3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pabpc1lA2A5N3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pabpc1lA2A5N3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pabpc1lA2A5N3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pabpc1lA2A5N3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pabpc1lA2A5N3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pabpc1lA2A5N3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pabpc1lA2A5N3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pabpc1lA2A5N3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pabpc1lA2A5N3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pabpc1lA2A5N3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pabpc1lA2A5N3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pabpc1lA2A5N3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pabpc1lA2A5N3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms