Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RPT6

4930433I11Rik, RIKEN cDNA 4930433I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930433I11RikA0A0U1RPT6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930433I11RikA0A0U1RPT6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms