Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
1700019A02RikA0A087WPV9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
1700019A02RikA0A087WPV9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms